MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis CIP 52.97 chromosome

Total Repeats: 43960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017307	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
2	NC_017307	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
3	NC_017307	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	387137614
4	NC_017307	ACT	2	6	202	207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
5	NC_017307	TGCA	2	8	275	282	25 %	25 %	25 %	25 %	387137614
6	NC_017307	TGC	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
7	NC_017307	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137614
8	NC_017307	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	387137614
9	NC_017307	TTC	3	9	456	464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137614
10	NC_017307	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
11	NC_017307	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	387137614
12	NC_017307	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
13	NC_017307	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	387137614
14	NC_017307	CTG	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
15	NC_017307	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	387137614
16	NC_017307	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137614
17	NC_017307	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
18	NC_017307	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
19	NC_017307	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	387137614
20	NC_017307	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	387137614
21	NC_017307	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	387137614
22	NC_017307	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	387137614
23	NC_017307	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387137614
24	NC_017307	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
25	NC_017307	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
26	NC_017307	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	387137614
27	NC_017307	ACT	2	6	1204	1209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137614
28	NC_017307	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	387137614
29	NC_017307	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
30	NC_017307	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137614
31	NC_017307	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137614
32	NC_017307	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
33	NC_017307	CGA	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
34	NC_017307	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
35	NC_017307	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	387137614
36	NC_017307	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	387137614
37	NC_017307	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	387137614
38	NC_017307	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137614
39	NC_017307	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137614
40	NC_017307	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137614
41	NC_017307	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137614
42	NC_017307	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137614
43	NC_017307	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	387137615
44	NC_017307	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137615
45	NC_017307	TTA	2	6	2196	2201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017307	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017307	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017307	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017307	GAAG	2	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	387137616
50	NC_017307	CCCA	2	8	2484	2491	25 %	0 %	0 %	75 %	387137616
51	NC_017307	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
52	NC_017307	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
53	NC_017307	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137616
54	NC_017307	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137616
55	NC_017307	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137616
56	NC_017307	CTGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	25 %	50 %	387137616
57	NC_017307	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137616
58	NC_017307	TC	3	6	3005	3010	0 %	50 %	0 %	50 %	387137616
59	NC_017307	GAAA	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	387137616
60	NC_017307	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137616
61	NC_017307	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137616
62	NC_017307	TTAC	2	8	3398	3405	25 %	50 %	0 %	25 %	387137616
63	NC_017307	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137616
64	NC_017307	CTG	2	6	3594	3599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017307	TCGT	2	8	3683	3690	0 %	50 %	25 %	25 %	387137617
66	NC_017307	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137617
67	NC_017307	AT	3	6	3782	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	387137617
68	NC_017307	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137617
69	NC_017307	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137617
70	NC_017307	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137617
71	NC_017307	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137617
72	NC_017307	TCA	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137617
73	NC_017307	A	6	6	4463	4468	100 %	0 %	0 %	0 %	387137617
74	NC_017307	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137617
75	NC_017307	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137617
76	NC_017307	GCC	2	6	4734	4739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137617
77	NC_017307	AAGG	2	8	4839	4846	50 %	0 %	50 %	0 %	387137617
78	NC_017307	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137618
79	NC_017307	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137618
80	NC_017307	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137618
81	NC_017307	TC	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	387137618
82	NC_017307	A	6	6	5024	5029	100 %	0 %	0 %	0 %	387137618
83	NC_017307	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137618
84	NC_017307	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137618
85	NC_017307	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	387137618
86	NC_017307	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137618
87	NC_017307	AC	3	6	5199	5204	50 %	0 %	0 %	50 %	387137618
88	NC_017307	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137618
89	NC_017307	ATAC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	387137618
90	NC_017307	TAA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017307	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	387137619
92	NC_017307	GTGGA	2	10	5772	5781	20 %	20 %	60 %	0 %	387137619
93	NC_017307	ATGC	2	8	5816	5823	25 %	25 %	25 %	25 %	387137619
94	NC_017307	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
95	NC_017307	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
96	NC_017307	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387137619
97	NC_017307	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387137619
98	NC_017307	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387137619
99	NC_017307	CGT	2	6	6128	6133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
100	NC_017307	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
101	NC_017307	A	6	6	6261	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	387137619
102	NC_017307	CCGATG	2	12	6273	6284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387137619
103	NC_017307	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
104	NC_017307	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
105	NC_017307	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
106	NC_017307	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137619
107	NC_017307	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
108	NC_017307	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
109	NC_017307	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
110	NC_017307	CG	3	6	6577	6582	0 %	0 %	50 %	50 %	387137619
111	NC_017307	AATCT	2	10	6609	6618	40 %	40 %	0 %	20 %	387137619
112	NC_017307	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137619
113	NC_017307	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387137619
114	NC_017307	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387137619
115	NC_017307	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137619
116	NC_017307	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
117	NC_017307	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137619
118	NC_017307	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
119	NC_017307	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387137619
120	NC_017307	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387137619
121	NC_017307	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137619
122	NC_017307	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387137619
123	NC_017307	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
124	NC_017307	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
125	NC_017307	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137619
126	NC_017307	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137619
127	NC_017307	A	6	6	7624	7629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017307	TAG	3	9	7673	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017307	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137620
130	NC_017307	T	6	6	7804	7809	0 %	100 %	0 %	0 %	387137620
131	NC_017307	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137620
132	NC_017307	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137620
133	NC_017307	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387137620
134	NC_017307	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137620
135	NC_017307	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387137620
136	NC_017307	AT	3	6	8127	8132	50 %	50 %	0 %	0 %	387137620
137	NC_017307	ATG	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017307	TA	4	8	8189	8196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017307	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017307	ACG	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017307	TTC	2	6	8265	8270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017307	T	7	7	8287	8293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017307	ATT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387137621
144	NC_017307	TTA	2	6	8411	8416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017307	GAAA	2	8	8471	8478	75 %	0 %	25 %	0 %	387137622
146	NC_017307	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
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149	NC_017307	TGC	2	6	8652	8657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137622
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161	NC_017307	TTC	2	6	9573	9578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387137624
162	NC_017307	CG	3	6	9582	9587	0 %	0 %	50 %	50 %	387137624
163	NC_017307	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137624
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169	NC_017307	CG	3	6	10047	10052	0 %	0 %	50 %	50 %	387137624
170	NC_017307	TGC	2	6	10158	10163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387137624
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242	NC_017307	GAA	2	6	13215	13220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017307	GTT	2	6	13241	13246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
244	NC_017307	T	7	7	13264	13270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017307	GT	3	6	13330	13335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
246	NC_017307	GGT	2	6	13362	13367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
247	NC_017307	T	6	6	13379	13384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_017307	GAC	2	6	13463	13468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_017307	CAA	2	6	13491	13496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_017307	CAT	2	6	13501	13506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_017307	TTGT	2	8	13537	13544	0 %	75 %	25 %	0 %	387137627
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256	NC_017307	GCCC	2	8	13687	13694	0 %	0 %	25 %	75 %	387137627
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260	NC_017307	TGA	2	6	13855	13860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387137627
261	NC_017307	GAA	2	6	13922	13927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387137627
262	NC_017307	AGTG	2	8	13936	13943	25 %	25 %	50 %	0 %	387137627
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